Zespół Genomiki Obliczeniowej

Kierownik Zespołu: dr Marcin Tabaka

Zainteresowania badawcze naszej grupy  koncentrują się na wykorzystaniu wysokowydajnych technologii sekwencjonowania pojedynczych komórek w celu zrozumienia heterogeniczności komórkowej zdrowych i chorych złożonych tkanek, ze szczególnym uwzględnieniem oka. Zachęcamy wysoce zmotywowane osoby do skontaktowania się z nami w sprawie możliwości współpracy naukowej.

Opis tematyki badawczej

By uzyskać wiedzę na temat złożoności systemów i procesów biologicznych, konieczne jest zmierzenie i opis interesujących nas cech w pojedynczych komórkach. Transkryptomika i epigenomika pojedynczych komórek pozwalają badaczom odkrywać rzadkie typy komórek, ujawniać różnorodność populacji komórek, wnioskować o trajektoriach rozwojowych linii komórkowych i odkrywać ich mechanizmy regulacyjne. Ostatnie postępy w opracowywaniu wysokowydajnych metod pojedynczych komórek pozwalają naukowcom badać typy komórek i stany ogromnej liczby komórek (1 milion i więcej).

Kontakt:

Tel: +48 609 877 462

Lider: Marcin Tabaka, mtabaka@ichf.edu.pl

Koordynatorka: Lidia Wolińska-Nizioł, lwolinska-niziol@ichf.edu.pl

Zespół:

Lider:

Marcin Tabaka
Projekty: OPUS 21 2021/41/B/NZ7/03786,
NdS-II/SP/0195/2023/01,
OPUS 25 2023/49/B/NZ9/01925
MAB II (FENG.02.01IP.05-T005/23)

Badacze (Post-docs):

Joanna Bem
Projekt: Weave-Unisono 2023/05/Y/NZ6/00083

Aleksandra Kornacka-Stackonis
Projekt: Sonata Bis 12 2022/46/E/NZ2/00370

Natalia Ochocka-Lewicka
Projekt: Sonatina 8 2024/52/C/NZ2/00230
Science for the Society NdS-II/SP/0195/2023/01

Stefania Robakiewicz
Projekt: MAB II (FENG.02.01IP.05-T005/23)

Doktoranci:

Maciej Ficek
Projekt: Sonata Bis 12 2022/46/E/NZ2/00370

Piotr Rutkowski
Projekt: Preludium 2022/45/N/NZ2/02311

Specjalista naukowy:

Kamil Krawczyński
Projekt: Sonata Bis 12 2022/46/E/NZ2/00370

Bioinformatyk:

Damian Panas
Projekt: MAB II (FENG.02.01IP.05-T005/23)

Specjaliści techniczni:

Nataliya Galagan
Projekt: NdS-II/SP/0195/2023/01

Lidia Wolińska-Nizioł
Projekt: MAB II (FENG.02.01IP.05-T005/23)

Stażyści:

Hussein Nasrallah
staż Eramus+

Katarzyna Wojtak
Projekt: Sonatina 8 2024/52/C/NZ2/00230

Katarzyna Michalak
Projekt: Weave-Unisono 2023/05/Y/NZ6/00083

Źródła finansowania: