dr Damian Panas

W latach 2017-2021 dr Panas był pracownikiem badawczo-dydaktycznym w Zakładzie Informatyki Radiologicznej i Statystyki Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego, a następnie w latach 2021-2022 pracował jako bioinformatyk i analityk danych w Laboratorium Biologii Molekularnej Instytutu Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności Polskiej Akademii Nauk w Olsztynie. Do głównych zadań dr Damiana Panasa w Zespole Genomiki Obliczeniowej, gdzie obecnie pracuje na stanowisku Specjalisty Technicznego w ICTER, należy tworzenie i wdrażanie nowych algorytmów obliczeniowych do zastosowania w wielowymiarowych analizach danych sekwencjonowania pojedynczych komórek oraz nadzór nad infrastrukturą obliczeniową.

A. Żurowska, R. Peksa, M. Grzywińska, D. Panas, M. Sowa, K. Skrobisz, M. Matuszewski, E. Szurowska, Comparison of Diffusion Kurtosis Imaging and Standard Mono-Exponential Apparent Diffusion Coefficient in Diagnosis of Significant Prostate Cancer-A Correlation with Gleason Score Assessed on Whole-Mount Histopathology Specimens, Diagnostics 13 (2), 173, (2023)
B. Czaplewski, M. Dzwonkowski, D. Panas, Convolutional Neural Networks for C. Elegans Muscle Age Classification Using Only Self-learned Features, Journal of Telecommunications and Information Technology, 4, 84-96, (2022)
D. Bielińska-Wąż, P. Wąż, D. Panas, Applications of 2D and 3D-Dynamic Representations of DNA/RNA Sequences for a Description of Genome Sequences of Viruses, Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening, 25 (3), 429-438, (2022)
K. Banaszkiewicz, K. Sikorska, D. Panas, K. Sworczak, The Role of the Trabecular Bone Score in the Assessment of Osteoarticular Disorders in Patients with HFE-Hemochromatosis: A Single-Center Study from Poland, Genes 12 (9), (2021)
K. Banaszkiewicz, K. Sikorska, D. Panas, Ł. Obołończyk, K. Sworczak, Low incidence of focal lesions in the thyroid gland in patients with hereditary hemochromatosis — a single center study from Poland, Endokrynologia Polska,72 (2), (2021)
D. Bielińska-Wąż, D. Panas, P. Wąż, Dynamic Representations of Biological Sequences, MATCH Commun Math Comput Chem 82(1), 205-218, (2019)
D. Panas, P. Wąż, D. Bielińska-Wąż, A. Nandy, S.C. Basak, An Application of the 2D-Dynamic Representation of DNA/RNA Sequences to the Prediction of Influenza A Virus Subtypes, MATCH Commun Math Comput Chem, 80 (2),295-310, (2018)
D. Panas, P. Wąż, D. Bielińska-Wąż, A. Nandy, S.C Basak, 2D-Dynamic Representation of DNA /RNA Sequences as a Characterization Tool of the Zika Virus Genome, MATCH Commun Math Comput Chem, 77 (2), 321-332, (2017)

Grupy badawcze

Badania prowadzone przez ZGO skupiają się na łączeniu podejść statystyki, fizyki statystycznej, matematyki i informatyki w rozwijaniu nowych metod obliczeniowych.

Projekty

15.12.2024

Opracowanie nowych podejść eksperymentalnych i narzędzi obliczeniowych do analizy danych sekwencjonowania pojedynczych komórek

Prace obliczeniowe w naszym laboratorium koncentrują się na opracowywaniu nowych algorytmów i skalowalnych narzędzi do analizy ogromnych zbiorów danych pochodzących z eksperymentów oraz ich integracji między platformami i technikami. W szczególności jesteśmy zainteresowani tworzeniem nowych podejść do kompleksowego wnioskowania o trajektoriach rozwojowych i określania atlasów komórek na podstawie sekwencjonowania pojedynczych komórek, zrozumienia komunikacji pomiędzy komórkami […]

Grupy badawcze

Zespół Genomiki Obliczeniowej

Projekty

Opracowanie nowych podejść eksperymentalnych i narzędzi obliczeniowych do analizy danych sekwencjonowania pojedynczych komórek