dr Natalia Ochocka-Lewicka

W czasie studiów doktoranckich w Instytucie Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego dr Ochocka-Lewicka badała rolę komórek odpornościowych w rozwoju glejaków oraz była zaangażowana w projekty komercyjne nad immunoterapiami TCR.

Dr Ochocka-Lewicka była kierownikiem grantu NCN Preludium, jest laureatką nagrody FNP START oraz współautorką 8 publikacji naukowych w tym prac opublikowanych w Nature Communications oraz Cell Reports.

Ochocka N., Segit P., Wojnicki K., Cyranowski S., Swatler J., Jacek K., Grajkowska W., & Kaminska B. (2021). “Specialized functions and sexual dimorphism explain functional diversity of the myeloid populations during glioma progression.” Cell Reports 42 (2023), 111971 https://doi.org/10.1016/j.celrep.2022.111971
Ochocka N., Segit P., Walentynowicz K. A., Wojnicki K., Cyranowski S., Swatler J., Mieczkowski J., & Kaminska B. (2021). ”Single-cell RNA sequencing reveals functional heterogeneity of glioma-associated brain macrophages.” Nature Communications, 12(1151), https://doi.org/10.1038/s41467-021-21407-w
Ochocka N, Kaminska B. “Microglia Diversity in Healthy and Diseased Brain: Insights from Single-Cell Omics.” International Journal of Molecular Science. 2021 Mar;22(6). DOI: 10.3390/ijms22063027.
Kaminska B, Ochocka N, Segit P “Single-cell omics in dissecting immune microenvironment of malignant gliomas – challenges and perspectives” Cells 10(9), 2264 (2021). https://doi.org/10.3390/cells10092264
Pilanc P, Wojnicki K, Roura AJ, Cyranowski S, Ellert-Miklaszewska A, Ochocka N, Gielniewski B, Grzybowski MM, Błaszczyk R, Stańczak PS, Dobrzański P, Kaminska B. “A Novel Oral Arginase 1/2 Inhibitor Enhances the Antitumor Effect of PD-1 Inhibition in Murine Experimental Gliomas by Altering the Immunosuppressive Environment.” Front Oncol. 2021 Aug 24;11:703465. doi: 10.3389/fonc.2021.703465.
Ellert-Miklaszewska, A., Ochocka, N., Maleszewska, M., Ding, L., Laurini, E., Jiang, Y., Roura, A. J., Giorgio, S., Gielniewski, B., Pricl, S., Peng, L., & Kaminska, B. (2019). “Efficient and innocuous delivery of small interfering RNA to microglia using an amphiphilic dendrimer nanovector.” Nanomedicine, 14(18). https://doi.org/10.2217/nnm-2019-0176
Guneykaya, D., Ivanov, A., Hernandez, D. P., Haage, V., Wojtas, B., Meyer, N., Maricos, M., Jordan, P., Buonfiglioli, A., Gielniewski, B., Ochocka, N., Cömert, C., Friedrich, C., Artiles, L. S., Kaminska, B., Mertins, P., Beule, D., Kettenmann, H., & Wolf, S. A. (2018). “Transcriptional and Translational Differences of Microglia from Male and Female Brains.” Cell Reports, 24(10), 2773–2783. https://doi.org/10.1016/j.celrep.2018.08.001
Walentynowicz, K. A., Ochocka, N., Pasierbinska, M., Wojnicki, K., Stepniak, K., Mieczkowski, J., Ciechomska, I. A., & Kaminska, B. (2018). “In search for reliable markers of glioma-induced polarization of microglia.” Frontiers in Immunology, 9(JUN), 1–13. https://doi.org/10.3389/fimmu.2018.01329

Grupy badawcze

Badania prowadzone przez ZGO skupiają się na łączeniu podejść statystyki, fizyki statystycznej, matematyki i informatyki w rozwijaniu nowych metod obliczeniowych.

Projekty

15.12.2024

Opracowanie nowych podejść eksperymentalnych i narzędzi obliczeniowych do analizy danych sekwencjonowania pojedynczych komórek

Prace obliczeniowe w naszym laboratorium koncentrują się na opracowywaniu nowych algorytmów i skalowalnych narzędzi do analizy ogromnych zbiorów danych pochodzących z eksperymentów oraz ich integracji między platformami i technikami. W szczególności jesteśmy zainteresowani tworzeniem nowych podejść do kompleksowego wnioskowania o trajektoriach rozwojowych i określania atlasów komórek na podstawie sekwencjonowania pojedynczych komórek, zrozumienia komunikacji pomiędzy komórkami […]

Grupy badawcze

Zespół Genomiki Obliczeniowej

Projekty

Opracowanie nowych podejść eksperymentalnych i narzędzi obliczeniowych do analizy danych sekwencjonowania pojedynczych komórek