Prace obliczeniowe w naszym laboratorium koncentrują się na opracowywaniu nowych algorytmów i skalowalnych narzędzi do analizy ogromnych zbiorów danych pochodzących z eksperymentów oraz ich integracji między platformami i technikami. W szczególności jesteśmy zainteresowani tworzeniem nowych podejść do kompleksowego wnioskowania o trajektoriach rozwojowych i określania atlasów komórek na podstawie sekwencjonowania pojedynczych komórek, zrozumienia komunikacji pomiędzy komórkami oraz ścieżek biologicznych wpływających bezpośrednio na zmiany pomiędzy stanami komórek w procesach rozwojowych i chorobowych. Zajmujemy się także tworzeniem nowych metod wizualizacji danych wielowymiarowych i multimodalnych do obrazowania topografii atlasów komórkowych. Sekwencjonowanie multiomiczne pojedynczych komórek pozwolą nam lepiej zrozumieć mikrośrodowisko nowotworów poprzez głębsze poznanie komunikacji międzykomórkowej między subpopulacjami komórek odpornościowych. Badania i analizy przez nas prowadzone przyczyniają się do poszerzenia wiedzy na temat biologii nowotworów, w tym czerniaka błony naczyniowej oka, również w aspekcie nowych terapii leczniczych.

Źródła finansowania:


